Scientific Agent Skills : un agent de code au service du labo
Un agent écrit du Python sans peine, mais il se trompe souvent sur les bibliothèques scientifiques, les formats de données et les conventions d'un domaine. K-Dense rassemble 177 consignes ciblées pour des paquets comme RDKit et Scanpy, pour des bases de données publiques et pour des protocoles complets, avec les vérifications propres à chaque méthode.
Interrogation de bases : le skill database-lookup documente 80 sources, de PubChem et UniProt à ClinicalTrials.gov et FRED.
Plus de 70 skills dédiés à des paquets Python selon leur version : RDKit, Scanpy, scikit-learn, Biopython, Qiskit, pymatgen, OpenMM.
Intégrations avec des plateformes de laboratoire : Benchling, DNAnexus, LatchBio, Protocols.io, Opentrons et quelques autres.
Aide à la communication : revue de littérature, gestion des citations, posters PPTX, diapositives, schémas et diagrammes Mermaid.
Démarche de recherche : plan d'expérience, hypothèses bornées par les preuves, demandes de subvention et modélisation PK/PD.
Quand s’en servir
Vous traitez des données RNA-seq en cellule unique ou en bulk sans vouloir réapprendre l'API de Scanpy.
Un article exige des données sur des composés tirées de PubChem et ChEMBL, avec la source de chaque valeur.
Vous rédigez un protocole ou une réponse aux relecteurs et voulez que l'agent respecte les usages du domaine.
Demandez à l’agent
Calcule avec RDKit les propriétés de Lipinski de ces SMILES et enregistre le tableau en CSV
Cherche TP53 dans UniProt et la PDB et résume les structures connues
Aide-moi à concevoir une expérience en blocs randomisés pour comparer trois conditions de culture
Questions
Comment installer Scientific Agent Skills ?
Lancez npx skills add K-Dense-AI/scientific-agent-skills puis choisissez les skills utiles. Le dépôt est aussi un paquet Agent Plugins avec plugin.json, que les clients compatibles chargent comme un seul plugin.
Est-ce que ça marche dans Codex et Cursor ?
Oui. Les auteurs citent Cursor, Claude Code, Codex et Google Antigravity, ainsi que tout client compatible avec le standard ouvert Agent Skills.
Quelle différence avec Claude Scientific Skills ?
Aucune sur le fond : c'est le même projet renommé. Les skills restent les mêmes, mais elles visent désormais tout agent conforme au standard Agent Skills, pas seulement Claude.
